Kalsit tersebar luas di alam.
Di laut dangkal atau danau, sering kali mengendap membentuk lapisan batu kapur yang luas.
Air tanah dapat melarutkan batu kapur dan juga membentuk kembali kalsit, seperti pada stalaktit, stalagmit, dan travertine. Air tanah yang aktif di dalam tanah dekat permukaan air seringkali membentuk bintil-bintil kalsit yang tersebar sepanjang bidang horizontal tertentu; ahli geologi biasanya menyebutnya sebagai nodul berkapur.
Aktivitas hidrotermal seringkali membentuk urat kalsit, sebagian mengandung mineral dan sebagian lagi tidak. Kristal-yang terbentuk dengan baik sering ditemukan di geode.
Dalam karbonat yang dibentuk oleh aktivitas magmatik, kalsit biasanya berjumlah sekitar 80%.
Selain itu, kalsit juga berperan sebagai semen pada batuan sedimen klastik dan sebagai mineral yang berasal dari alterasi batuan beku dasar sehingga berkontribusi terhadap berbagai batuan. Karena aktivitas air tanah, urat kalsit sering kali mengisi celah-celah berbagai batuan.
Batu kapur yang terbentuk melalui sedimentasi sering kali mengalami metamorfisme regional atau kontak, yang mana dalam proses tersebut kalsit di dalamnya mengkristal kembali membentuk agregat kalsit-marmer yang lebih kasar.
